“毫发差殊不结丹”的含义是：哪怕有极其细微的差错就无法结成金丹。这是希望人们能够仔细地洞察阴阳的奥秘，深刻地明白天地造化的规律，精准地把握时间（如同准则刻漏一般准确），细致地推算炼丹的火候，既不能火候太过，也不能火候不足，这样才能炼制出金丹服用，进而实现脱胎换骨的效果。如果在这个过程中有一丝一毫的差错，那就如同走了一百里路却在九十里的时候停下，功亏一篑。诗中归结出“古来妙合参同契”这两句话，这其实是整部书的主旨所在。
通天河这个地方，恰好处于十万八千里的半途之中，在这里提出还元的概念，是为了凑满九九之数，以此表明九九之数哪怕缺少一个，就如同在通天河这里半途而废一样。特别提到“通天”这个词，天所在的地方距离是五万四千里，也就是一藏之数，正是观音大士用鱼篮救元的时候。虽然说这只是一半的工夫，但后面一半的工夫其实也只是对前面一半工夫的完善罢了。老子说：“玄之又玄。”其中“玄之”说的是前半部分；“又玄”说的是后半部分。如果不是祖师亲自传授其中玄妙的旨意，怎么能够理解呢？哎！通天还原的旨意是非常微妙的，仔细阅读文中“九九归真”这首诗，或许可以领悟到一二分。
“孙悟空抬头回望说道：‘是这里！是这里！’”读者可能会认为这只是孙悟空的一句闲话，却不知道这其中有很大的关联。他明明认得出通天河这个地方，为什么还要仔细观察并且反复强调呢？这是说在修行功夫上如果有差错的地方，就是在这里了，所以要仔细，一定要牢牢记住不要忘记。“猪八戒对沙僧说：‘想来这是你的老家了。’孙悟空说：‘不是！不是！这是通天河。’”说出“祖家”这个词，反复地指明，这是多么大的提醒啊！孙悟空说：“驾不去！驾不去！”这是说九九之数有其自然而然的功夫，不是人力可以勉强做到的，正所谓‘自有天然真火候，何须柴炭及吹嘘”。老鼋高声叫道：“圣僧！这里来！这里来！”意思是从这里去，还要从这里回来。“师徒四人，连马一共五口，驮在老鼋身上”这就是《河图》的法象。正五行回归到一个太极之中，不分你我，就像人恢复了本来的面目，大道也归根复命了。
接下来老鼋突然发问，唐僧无言以对，然后身体一晃，所有人都掉进了水里，读者不能错误地理解这一段。此时唐僧的道果已经成就了，难道真的是还少一难必须补足吗？其实是因为结丹在这里，还元也在这里，哪怕有一丝一毫的差错，都不能成就真道。特意借老鼋这一段关于遗忘失信的公案，在通天河这个至关重要、极其紧要的关头进行叮咛嘱咐，说明这里有真正的关键所在，一定要牢牢记住，不能失信而产生丝毫的差错。这正是“八大金刚附耳低言‘如此如此，谨遵菩萨法旨，不得违误’”的真正传承，不是可以用言语文字直白说出来的。如果理解为道体纯粹是《乾》，不能容纳一丝一毫的阴气；灾星未满，还需要在这里补足，那就是没有理解还元的妙理。
“唐僧按住经书，沙僧压住经书，孙悟空在左右进行护持，以防备阴魔的破坏。”这表明这些经书在这个地方很容易出现差错和损失，急需进行保护，等待阴气消除。孙悟空说：“这些经书蕴含着夺天地造化的功绩，可以和乾坤一样长久，和日月一样明亮，能够享受长久的寿命，法身不会损坏。”这些都是金丹的实际意义，并不是夸张的形容。在即将成功的时候，恐怕会有外在的魔障侵蚀损耗、暗中夺取，最关键的是要严密地防范，千万不能疏忽怠慢。至于经书的末尾被沾破，“这是顺应天地不全的奥妙，不是人力可以改变的。”老子说“大成若缺，其用不敝”就是这个道理。有些读者说乾坤有缺陷，这是大的方面，这只是没有根据的空谈猜测罢了。有人说被这个人一口说破了，我却认为正是被这个人一口解释坏了。如果把“天地不全”解释为妙处，文章本身就有相关内容，哪里还用得着解释呢？只有其中“不全的奥妙”，需要真正的师父传授，怎么能通过揣摩就理解呢？哎！只有领悟了潮水源头消长的道理，才开始明白自身也有盈满和亏虚的变化。在丹道修行中，“三三行满”可从以下几个方面理解：
从数字象征意义来看
- 三才之理：“三”在传统文化中常与三才（天、地、人）相对应。“三三”可理解为对三才理念的深化与叠加。在丹道中，意味着要实现天、地、人三才在自身的和谐统一。修行者需顺应天道自然规律，立足大地汲取能量，同时修炼自身的人道（包括心性、品德等）。当这三个方面都达到圆满、和谐的状态，便符合了“三三行满”的象征意义。
- 三元完备：道家有上元、中元、下元三元的概念。上元主天官赐福，中元主地官赦罪，下元主水官解厄。“三三行满”可视为三元皆完备的状态，即修行者在丹道修行中获得了来自天地水三官所象征的福泽、赦罪和解厄等多种元素的圆满，表明自身在各方面的修行都已完备，没有缺陷与阻碍。
从修行阶段与境界角度来看
- 三个阶段的递进：“三三”可代表丹道修行的三个不同阶段。第一个“三”可象征着炼精化气、炼气化神、炼神还虚这三个基础且关键的阶段。当这三个阶段依次完成后，修行者在体内完成了初步的能量转化与精神凝练。第二个“三”则可表示在上述基础上更进一步的三个进阶阶段，如在还虚境界中对虚境的稳固、对道的体悟深化以及将道的体悟融入到日常生活的各个层面。当这两个层次的三个阶段都圆满完成，便实现了“三三行满”，达到了一种高深的修行境界。
- 三境合一：它也可理解为三种不同修行境界的融合与圆满。例如，初境为对丹道功法的熟练掌握与初步的身体调理；中境是在功法基础上对心性的深度修炼，达到内心的宁静与超脱；高境则是将丹道修行与天地万物相融合，实现与宇宙的共鸣。这三个境界层层递进，当修行者能够将它们完美融合，在每个境界都达到极致时，即实现了“三三行满”。
从内外兼修的角度来看
- 内外三元的圆满：从内外两个维度，各自划分出三个方面。内三元可指精、气、神的修炼圆满，即通过丹道的修炼方法，使体内的精气神达到充沛、和谐且能自如转化的状态。外三元可象征着在世间的行为、与他人的关系以及对社会的贡献等三个方面的圆满。当修行者不仅在自身精气神的修炼上达到极致，而且在对外的行为与影响方面也做到尽善尽美，实现内外三元的统一与和谐，便是“三三行满”在丹道修行中的体现。
- 身心与天地的和谐：“三三行满”还意味着身心两个层面与天地自然三个方面的和谐统一。身、心、意构成了修行者自身的三个关键要素，而天、地、万物构成了外部环境的三个主要范畴。在丹道修行中，要使身与天地之规律相合，心与天地之宽广相融，意与天地之神韵相通，当这三个层面的融合都达到圆满状态时，就符合了“三三行满”的要求。